2011年4月1日国务院总理温家宝、李克强在中南海接见参加中国工程院向国家咨询的两院院士。总理充分肯定了过去10年两院院士咨询工作的贡献。 

我院刘昌明院士过去十余年，参加中国科学院、中国工程院咨询项目近三十项，围绕水领域问题开展咨询研究，为国家解决重大水问题献计献策，为国家水战略提供了科学咨询意见。

在中国科学院/学部/院士工作局等组织的重大咨询项目中，刘昌明院士在“中国水问题出路”、黄河断流对策”、“中国饮水安全与农业水资源战略”等水资源战略和安全的重大水问题中提供咨询建议，具体有：

1997-1998年中国科学院国家咨询项目“中国水问题出路”，孙鸿烈主持，主要报告编写；

1998年7-8月中国科学院国家咨询项目“黄河断流对策”，徐冠华主持，主要报告编写；

1999年9-10月中国科学院与中国工程院两院咨询项目“长江洪水与防洪对策”，主要参加；

2005-2006年中国科学院/院士局/学部重大咨询项目“中国饮水安全与农业水资源战略”，项目负责人；

2006-2007年中国科学院重大咨询项目 “新疆生态建设与可持续发展研究”，张新时负责，参与；

2006-2007年中国科学院重大咨询项目“新疆地下水地表水联合开发利用”汪集暘、刘昌明负责；

2009-2010年中国科学院重大咨询项目“中国水问题”，孙鸿烈负责，课题四负责人；

2010年中国科学院重大咨询项目 “南水北调中线工程核心水源区生态经济可持续发展研究咨询”，李德仁负责，参与；

2011年中国科学院重大咨询项目“新疆洪水调控利用与地下水储备战略” 汪集暘、刘昌明负责；

2008-2010以及2011年中国科学院院士工作局、中国工程院学部工作局、中国科协学会学术部、新疆维吾尔自治区科协 “天山南北院士行”科技咨询项目，主要参加水资源咨询。

从“98洪水”咨询项目开始，到2011年3-6月的“长江口深水航道工程评估项目”，参加的中国工程院多个咨询项目，具体包括：

1999-9-10月“长江洪水与防洪对策”（中国工程院与中国科学院两院项目）；

1999-2001国家重大咨询项目:“中国可持续发展水资源战略”(中国工程院)，担任水资源组组长；

2002-2003 “西北地区水资源配置生态环境建设与可持续发展”(中国工程院)，担任生态与环境组组长；

2004-2005“东北水土资源、生态与环境保护、可持续发展”(中国工程院)，担任生态与环境组组长；

2006-2007“苏北沿海地区产业综合开发战略，负责环境”(中国工程院、开发银行、江苏省委省政府)，担任生态与环境组组长；

2008-2009“新疆可持续发展中有关水资源的战略”（中国工程院，新疆自治区），担任顾问；

2009-2010“浙江省沿海及海岛综合开发战略研究”(中国工程院、开发银行、浙江省委省政府)，水旱灾害防治与水资源配置课题组副组长；

2011年3-6月，“长江口深水航道工程评估项目”(中国工程院)，工程环境影响评价组组长。